Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM3A6NDB9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM3A6NDB9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms