Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
EFCAB5A4FU69 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
EFCAB5A4FU69 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB5A4FU69 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms