Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX13Q9Y5W8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms