Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA8Q9Y5G5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA8Q9Y5G5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms