Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FCF1Q9Y324 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms