Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO6Q9UM54 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO6Q9UM54 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO6Q9UM54 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO6Q9UM54 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO6Q9UM54 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO6Q9UM54 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms