Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC34Q96HJ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms