Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms