Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms