Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED8Q8IZ13 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms