Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTU1Q7Z7A3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms