Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MRNIPQ6NTE8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRNIPQ6NTE8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRNIPQ6NTE8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRNIPQ6NTE8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRNIPQ6NTE8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MRNIPQ6NTE8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRNIPQ6NTE8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRNIPQ6NTE8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms