Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MLIPQ5VWP3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLIPQ5VWP3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms