Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
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