Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPNMBQ14956 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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