Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 ZNF548-211ENST00000600927 616 ntTSL 37.78□□□□□ -1.168e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AIG1-204ENST00000367601 727 ntTSL 57.68□□□□□ -1.188e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AIG1-205ENST00000447498 444 ntTSL 57.49□□□□□ -1.218e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ANP32B-203ENST00000486769 400 ntTSL 27.06□□□□□ -1.283e-11■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AC003002.4-201ENST00000596617 536 ntAPPRIS P1 TSL 46.92□□□□□ -1.38e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF548-205ENST00000596282 569 ntTSL 56.88□□□□□ -1.318e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AC003002.2-201ENST00000597658 456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.328e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF548-207ENST00000597400 589 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.338e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AC003002.4-203ENST00000596400 630 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.358e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 LONP2-206ENST00000565867 1969 ntTSL 36.51□□□□□ -1.378e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.388e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.478e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF548-206ENST00000597047 682 ntTSL 35.86□□□□□ -1.478e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF548-203ENST00000594668 563 ntTSL 55.72□□□□□ -1.498e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 RPTOR-206ENST00000573746 688 ntTSL 25.65□□□□□ -1.58e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZFC3H1-208ENST00000550712 571 ntTSL 44.83□□□□□ -1.648e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.78e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.858e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 SH3PXD2A-204ENST00000420222 3251 ntTSL 211.57□□□□□ -0.568e-7■■□□□ 11.6
SRSF9Q13242 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.578e-7■■□□□ 11.6
SRSF9Q13242 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.738e-7■■□□□ 11.6
SRSF9Q13242 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.28e-7■■□□□ 11.6
SRSF9Q13242 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-8■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 MAT2A-205ENST00000481412 1438 ntTSL 1 (best)8.92□□□□□ -0.982e-8■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.292e-8■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 312.02□□□□□ -0.491e-7■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 FTCD-211ENST00000494498 840 ntTSL 312.02□□□□□ -0.491e-7■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 FTCD-206ENST00000460011 1260 ntTSL 1 (best)11.83□□□□□ -0.521e-7■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.438e-9■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 211.87□□□□□ -0.518e-9■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.718e-9■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.748e-9■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.88e-9■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.868e-9■■□□□ 11.5
SRSF9Q13242 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 CDK12-209ENST00000584632 4165 ntTSL 510.63□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 LINC00511-214ENST00000581801 379 ntTSL 36.75□□□□□ -1.332e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 518.23■□□□□ 0.514e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 SGSM2-207ENST00000573062 1335 ntTSL 217.58■□□□□ 0.44e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.274e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 215.73■□□□□ 0.114e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 515.53■□□□□ 0.084e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.044e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.054e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PCF11-203ENST00000530304 2649 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.094e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.144e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TPD52-217ENST00000521241 723 ntTSL 514.1□□□□□ -0.154e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 EMILIN2-203ENST00000583776 775 ntTSL 1 (best)13.85□□□□□ -0.194e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.284e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 EMILIN2-202ENST00000308080 1544 ntTSL 513.23□□□□□ -0.294e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PCF11-207ENST00000624931 1720 nt13.15□□□□□ -0.34e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.314e-6■■□□□ 11.4
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SRSF9Q13242 TCIRG1-209ENST00000529657 842 ntTSL 512.62□□□□□ -0.394e-6■■□□□ 11.4
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SRSF9Q13242 TPD52-215ENST00000520795 445 ntTSL 212.48□□□□□ -0.414e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TCIRG1-206ENST00000527530 529 ntTSL 312.06□□□□□ -0.484e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TPD52-226ENST00000523753 587 ntTSL 412.05□□□□□ -0.484e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 COL27A1-205ENST00000485397 463 ntTSL 511.93□□□□□ -0.54e-6■■□□□ 11.4
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SRSF9Q13242 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.544e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.544e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TPD52-218ENST00000521354 785 ntTSL 211.64□□□□□ -0.554e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 211.63□□□□□ -0.554e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 LPCAT1-206ENST00000514484 756 ntTSL 311.63□□□□□ -0.554e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 SGSM2-213ENST00000574857 3885 ntTSL 211.5□□□□□ -0.574e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TCIRG1-202ENST00000524598 940 ntTSL 511.2□□□□□ -0.624e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PCF11-204ENST00000530660 3309 ntTSL 211.07□□□□□ -0.644e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.644e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PCF11-206ENST00000533018 580 ntTSL 311.02□□□□□ -0.654e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.684e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.774e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TCIRG1-208ENST00000529364 868 ntTSL 39.76□□□□□ -0.854e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.914e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PECR-207ENST00000487318 742 ntTSL 59.34□□□□□ -0.914e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PECR-208ENST00000497889 824 ntTSL 59.14□□□□□ -0.954e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 59.05□□□□□ -0.964e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 GDF15-204ENST00000597765 562 ntTSL 49.03□□□□□ -0.962e-9■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -14e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.024e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TRAF4-215ENST00000584944 825 ntTSL 28.64□□□□□ -1.034e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 28.62□□□□□ -1.034e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 AC007388.1-205ENST00000445520 499 ntTSL 28.58□□□□□ -1.044e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PECR-202ENST00000442122 1100 ntTSL 28.51□□□□□ -1.054e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PECR-206ENST00000474093 585 ntTSL 28.42□□□□□ -1.064e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-202ENST00000359429 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.094e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 SGSM2-203ENST00000570431 392 ntTSL 37.99□□□□□ -1.134e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TRAF4-209ENST00000473421 585 ntTSL 37.83□□□□□ -1.164e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-201ENST00000354506 3165 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.244e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-206ENST00000429921 2511 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.264e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TRAF4-206ENST00000454852 672 ntTSL 37.11□□□□□ -1.274e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-214ENST00000452025 779 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.354e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.414e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 LPCAT1-205ENST00000513757 547 ntTSL 46.07□□□□□ -1.444e-6■■□□□ 11.4
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