RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533947.1

TCIRG1-215, Transcript of T cell immune regulator 1, ATPase H+ transporting V0 subunit a3, humanhuman

TSL 5

Gene TCIRG1, Length 956 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1-215ENST00000533947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.94■■■■■ 5.91
TCIRG1-215ENST00000533947 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.37■■■■■ 5.01
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TCIRG1-215ENST00000533947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.01■■■■■ 4.64
TCIRG1-215ENST00000533947 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.92■■■■■ 4.62
TCIRG1-215ENST00000533947 NACADO15069 1562 aa43.77■■■■■ 4.6
TCIRG1-215ENST00000533947 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.19■■■■■ 4.5
TCIRG1-215ENST00000533947 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
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TCIRG1-215ENST00000533947 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.01■■■■■ 4.48
TCIRG1-215ENST00000533947 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.96■■■■■ 4.47
TCIRG1-215ENST00000533947 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.82■■■■■ 4.45
TCIRG1-215ENST00000533947 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.72■■■■■ 4.43
TCIRG1-215ENST00000533947 SCRIBQ14160 1630 aa42.47■■■■■ 4.39
TCIRG1-215ENST00000533947 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.06■■■■■ 4.32
TCIRG1-215ENST00000533947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.67■■■■■ 4.26
TCIRG1-215ENST00000533947 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
TCIRG1-215ENST00000533947 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.53■■■■■ 4.24
TCIRG1-215ENST00000533947 SMARCA4P51532 1647 aa40.45■■■■■ 4.07
TCIRG1-215ENST00000533947 NCAPD3P42695 1498 aa40.4■■■■■ 4.06
TCIRG1-215ENST00000533947 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.4■■■■■ 4.06
TCIRG1-215ENST00000533947 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
TCIRG1-215ENST00000533947 SMARCA2P51531 1590 aa40.27■■■■■ 4.04
TCIRG1-215ENST00000533947 HMGXB3Q12766 1538 aa40.15■■■■■ 4.02
TCIRG1-215ENST00000533947 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.09■■■■■ 4.01
TCIRG1-215ENST00000533947 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
TCIRG1-215ENST00000533947 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.96■■■■□ 3.99
TCIRG1-215ENST00000533947 ERCC6Q03468 1493 aa39.86■■■■□ 3.97
TCIRG1-215ENST00000533947 NESP48681 1621 aa39.8■■■■□ 3.96
TCIRG1-215ENST00000533947 WIZO95785 1651 aa39.64■■■■□ 3.94
TCIRG1-215ENST00000533947 CUX2O14529 1486 aa39.52■■■■□ 3.92
TCIRG1-215ENST00000533947 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.43■■■■□ 3.9
TCIRG1-215ENST00000533947 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
TCIRG1-215ENST00000533947 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.25■■■■□ 3.87
TCIRG1-215ENST00000533947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.23■■■■□ 3.87
TCIRG1-215ENST00000533947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.23■■■■□ 3.87
TCIRG1-215ENST00000533947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
TCIRG1-215ENST00000533947 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
TCIRG1-215ENST00000533947 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.09■■■■□ 3.85
TCIRG1-215ENST00000533947 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.92■■■■□ 3.82
TCIRG1-215ENST00000533947 CFTRP13569 1480 aa38.86■■■■□ 3.81
TCIRG1-215ENST00000533947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.85■■■■□ 3.81
TCIRG1-215ENST00000533947 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.85■■■■□ 3.81
TCIRG1-215ENST00000533947 WDR62O43379 1518 aa38.76■■■■□ 3.8
TCIRG1-215ENST00000533947 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.71■■■■□ 3.79
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TCIRG1-215ENST00000533947 PRDM2Q13029 1718 aa38.46■■■■□ 3.75
TCIRG1-215ENST00000533947 TOPBP1Q92547 1522 aa38.14■■■■□ 3.7
TCIRG1-215ENST00000533947 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
TCIRG1-215ENST00000533947 IFT140Q96RY7 1462 aa38.03■■■■□ 3.68
TCIRG1-215ENST00000533947 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.02■■■■□ 3.68
TCIRG1-215ENST00000533947 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
TCIRG1-215ENST00000533947 ABCC8Q09428 1581 aa37.99■■■■□ 3.67
TCIRG1-215ENST00000533947 OSCARQ8IYS5 282 aa37.84■■■■□ 3.65
TCIRG1-215ENST00000533947 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
TCIRG1-215ENST00000533947 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
TCIRG1-215ENST00000533947 TRIM41Q8WV44 630 aa37.74■■■■□ 3.63
TCIRG1-215ENST00000533947 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
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TCIRG1-215ENST00000533947 CUX1P39880 1505 aa37.64■■■■□ 3.62
TCIRG1-215ENST00000533947 SOGA1O94964 1423 aa37.63■■■■□ 3.61
TCIRG1-215ENST00000533947 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.63■■■■□ 3.61
TCIRG1-215ENST00000533947 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
TCIRG1-215ENST00000533947 FBLN2P98095 1184 aa37.48■■■■□ 3.59
TCIRG1-215ENST00000533947 CHD1O14646 1710 aa37.41■■■■□ 3.58
TCIRG1-215ENST00000533947 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.33■■■■□ 3.57
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TCIRG1-215ENST00000533947 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.31■■■■□ 3.56
TCIRG1-215ENST00000533947 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.31■■■■□ 3.56
TCIRG1-215ENST00000533947 WDR97A6NE52 1622 aa37.28■■■■□ 3.56
TCIRG1-215ENST00000533947 ARHGEF11O15085 1522 aa37.24■■■■□ 3.55
TCIRG1-215ENST00000533947 GRIN2BQ13224 1484 aa37.23■■■■□ 3.55
TCIRG1-215ENST00000533947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
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TCIRG1-215ENST00000533947 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.17■■■■□ 3.54
TCIRG1-215ENST00000533947 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
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TCIRG1-215ENST00000533947 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.08■■■■□ 3.53
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TCIRG1-215ENST00000533947 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.68■■■■□ 3.46
TCIRG1-215ENST00000533947 CEP170Q5SW79 1584 aa36.63■■■■□ 3.45
TCIRG1-215ENST00000533947 NUP160Q12769 1436 aa36.59■■■■□ 3.45
TCIRG1-215ENST00000533947 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
TCIRG1-215ENST00000533947 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.5■■■■□ 3.43
TCIRG1-215ENST00000533947 KIF27Q86VH2 1401 aa36.42■■■■□ 3.42
TCIRG1-215ENST00000533947 SHROOM2Q13796 1616 aa36.35■■■■□ 3.41
TCIRG1-215ENST00000533947 IGF1RP08069 1367 aa36.35■■■■□ 3.41
TCIRG1-215ENST00000533947 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
TCIRG1-215ENST00000533947 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.26■■■■□ 3.4
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