RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521241.6

TPD52-217, Transcript of tumor protein D52, humanhuman

TSL 5

Gene TPD52, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52-217ENST00000521241 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.09■■■■■ 6.73
TPD52-217ENST00000521241 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.32■■■■■ 5.81
TPD52-217ENST00000521241 ABCC9O60706 1549 aa51.13■■■■■ 5.77
TPD52-217ENST00000521241 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.8■■■■■ 5.4
TPD52-217ENST00000521241 NACADO15069 1562 aa48.49■■■■■ 5.35
TPD52-217ENST00000521241 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.96■■■■■ 5.27
TPD52-217ENST00000521241 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.92■■■■■ 5.26
TPD52-217ENST00000521241 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.91■■■■■ 5.26
TPD52-217ENST00000521241 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.66■■■■■ 5.22
TPD52-217ENST00000521241 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.53■■■■■ 5.2
TPD52-217ENST00000521241 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.34■■■■■ 5.17
TPD52-217ENST00000521241 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
TPD52-217ENST00000521241 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.26■■■■■ 5.16
TPD52-217ENST00000521241 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.87■■■■■ 5.09
TPD52-217ENST00000521241 SCRIBQ14160 1630 aa46.6■■■■■ 5.05
TPD52-217ENST00000521241 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.25■■■■■ 4.99
TPD52-217ENST00000521241 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
TPD52-217ENST00000521241 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.11■■■■■ 4.97
TPD52-217ENST00000521241 NCAPD3P42695 1498 aa44.75■■■■■ 4.75
TPD52-217ENST00000521241 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.57■■■■■ 4.73
TPD52-217ENST00000521241 SMARCA4P51532 1647 aa44.53■■■■■ 4.72
TPD52-217ENST00000521241 SMARCA2P51531 1590 aa44.49■■■■■ 4.71
TPD52-217ENST00000521241 HMGXB3Q12766 1538 aa44.45■■■■■ 4.71
TPD52-217ENST00000521241 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
TPD52-217ENST00000521241 CUX2O14529 1486 aa44.21■■■■■ 4.67
TPD52-217ENST00000521241 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.18■■■■■ 4.66
TPD52-217ENST00000521241 ERCC6Q03468 1493 aa44.18■■■■■ 4.66
TPD52-217ENST00000521241 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
TPD52-217ENST00000521241 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.1■■■■■ 4.65
TPD52-217ENST00000521241 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.93■■■■■ 4.62
TPD52-217ENST00000521241 NESP48681 1621 aa43.91■■■■■ 4.62
TPD52-217ENST00000521241 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.75■■■■■ 4.59
TPD52-217ENST00000521241 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
TPD52-217ENST00000521241 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.47■■■■■ 4.55
TPD52-217ENST00000521241 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.4■■■■■ 4.54
TPD52-217ENST00000521241 WIZO95785 1651 aa43.4■■■■■ 4.54
TPD52-217ENST00000521241 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.35■■■■■ 4.53
TPD52-217ENST00000521241 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.07■■■■■ 4.49
TPD52-217ENST00000521241 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
TPD52-217ENST00000521241 WDR62O43379 1518 aa43■■■■■ 4.47
TPD52-217ENST00000521241 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
TPD52-217ENST00000521241 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.9■■■■■ 4.46
TPD52-217ENST00000521241 CFTRP13569 1480 aa42.87■■■■■ 4.45
TPD52-217ENST00000521241 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.84■■■■■ 4.45
TPD52-217ENST00000521241 PRDM2Q13029 1718 aa42.5■■■■■ 4.39
TPD52-217ENST00000521241 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
TPD52-217ENST00000521241 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.38■■■■■ 4.38
TPD52-217ENST00000521241 OSCARQ8IYS5 282 aa42.1■■■■■ 4.33
TPD52-217ENST00000521241 IFT140Q96RY7 1462 aa42.07■■■■■ 4.33
TPD52-217ENST00000521241 TOPBP1Q92547 1522 aa42.04■■■■■ 4.32
TPD52-217ENST00000521241 ABCC8Q09428 1581 aa42.03■■■■■ 4.32
TPD52-217ENST00000521241 TRIM41Q8WV44 630 aa42.01■■■■■ 4.32
TPD52-217ENST00000521241 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
TPD52-217ENST00000521241 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.91■■■■■ 4.3
TPD52-217ENST00000521241 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
TPD52-217ENST00000521241 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
TPD52-217ENST00000521241 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
TPD52-217ENST00000521241 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.57■■■■■ 4.25
TPD52-217ENST00000521241 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.57■■■■■ 4.25
TPD52-217ENST00000521241 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.57■■■■■ 4.25
TPD52-217ENST00000521241 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.53■■■■■ 4.24
TPD52-217ENST00000521241 ARHGEF11O15085 1522 aa41.44■■■■■ 4.23
TPD52-217ENST00000521241 CHD1O14646 1710 aa41.42■■■■■ 4.22
TPD52-217ENST00000521241 SOGA1O94964 1423 aa41.39■■■■■ 4.22
TPD52-217ENST00000521241 WDR97A6NE52 1622 aa41.38■■■■■ 4.21
TPD52-217ENST00000521241 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.38■■■■■ 4.21
TPD52-217ENST00000521241 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.33■■■■■ 4.21
TPD52-217ENST00000521241 CUX1P39880 1505 aa41.28■■■■■ 4.2
TPD52-217ENST00000521241 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
TPD52-217ENST00000521241 FBLN2P98095 1184 aa41.18■■■■■ 4.18
TPD52-217ENST00000521241 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.14■■■■■ 4.18
TPD52-217ENST00000521241 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
TPD52-217ENST00000521241 GRIN2BQ13224 1484 aa41.08■■■■■ 4.17
TPD52-217ENST00000521241 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.04■■■■■ 4.16
TPD52-217ENST00000521241 ARAP1Q96P48 1450 aa41.02■■■■■ 4.16
TPD52-217ENST00000521241 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.99■■■■■ 4.15
TPD52-217ENST00000521241 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
TPD52-217ENST00000521241 SYNJ1O43426 1573 aa40.97■■■■■ 4.15
TPD52-217ENST00000521241 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
TPD52-217ENST00000521241 SYNJ2O15056 1496 aa40.95■■■■■ 4.15
TPD52-217ENST00000521241 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.92■■■■■ 4.14
TPD52-217ENST00000521241 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.91■■■■■ 4.14
TPD52-217ENST00000521241 PBRM1Q86U86 1689 aa40.91■■■■■ 4.14
TPD52-217ENST00000521241 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.85■■■■■ 4.13
TPD52-217ENST00000521241 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.72■■■■■ 4.11
TPD52-217ENST00000521241 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.7■■■■■ 4.11
TPD52-217ENST00000521241 TOP2BQ02880 1626 aa40.68■■■■■ 4.1
TPD52-217ENST00000521241 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
TPD52-217ENST00000521241 GRIN2AQ12879 1464 aa40.54■■■■■ 4.08
TPD52-217ENST00000521241 ADAMTS12P58397 1594 aa40.53■■■■■ 4.08
TPD52-217ENST00000521241 NUP160Q12769 1436 aa40.43■■■■■ 4.06
TPD52-217ENST00000521241 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.42■■■■■ 4.06
TPD52-217ENST00000521241 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.42■■■■■ 4.06
TPD52-217ENST00000521241 CEP170Q5SW79 1584 aa40.38■■■■■ 4.05
TPD52-217ENST00000521241 SHROOM2Q13796 1616 aa40.27■■■■■ 4.04
TPD52-217ENST00000521241 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.25■■■■■ 4.03
TPD52-217ENST00000521241 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
TPD52-217ENST00000521241 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.96■■■■□ 3.99
TPD52-217ENST00000521241 JPH4Q96JJ6 628 aa39.95■■■■□ 3.99
TPD52-217ENST00000521241 KIF27Q86VH2 1401 aa39.86■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms