Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT3P49368 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT3P49368 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT3P49368 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT3P49368 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT3P49368 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT3P49368 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT3P49368 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT3P49368 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT3P49368 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT3P49368 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCT3P49368 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT3P49368 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT3P49368 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT3P49368 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT3P49368 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT3P49368 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT3P49368 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT3P49368 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT3P49368 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT3P49368 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT3P49368 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT3P49368 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT3P49368 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT3P49368 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT3P49368 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms