Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCIP41743 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms