Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCK1P16333 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCK1P16333 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCK1P16333 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCK1P16333 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCK1P16333 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCK1P16333 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCK1P16333 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NCK1P16333 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCK1P16333 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCK1P16333 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCK1P16333 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCK1P16333 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCK1P16333 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCK1P16333 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCK1P16333 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCK1P16333 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCK1P16333 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCK1P16333 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCK1P16333 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCK1P16333 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCK1P16333 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCK1P16333 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCK1P16333 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCK1P16333 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCK1P16333 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCK1P16333 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCK1P16333 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCK1P16333 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCK1P16333 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCK1P16333 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCK1P16333 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCK1P16333 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCK1P16333 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCK1P16333 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCK1P16333 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCK1P16333 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCK1P16333 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCK1P16333 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCK1P16333 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCK1P16333 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCK1P16333 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms