Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1P04632 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms