Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC2O95347 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC2O95347 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC2O95347 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC2O95347 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC2O95347 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC2O95347 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC2O95347 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC2O95347 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC2O95347 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC2O95347 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC2O95347 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC2O95347 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC2O95347 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC2O95347 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC2O95347 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC2O95347 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC2O95347 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC2O95347 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC2O95347 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC2O95347 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC2O95347 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC2O95347 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC2O95347 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC2O95347 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC2O95347 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC2O95347 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC2O95347 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC2O95347 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC2O95347 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC2O95347 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms