Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRK9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRK9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRK9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRK9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRK9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRK9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
J3QRK9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRK9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRK9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRK9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRK9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRK9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRK9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRK9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRK9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRK9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRK9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRK9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRK9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRK9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRK9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRK9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRK9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRK9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRK9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRK9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRK9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRK9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRK9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRK9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRK9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRK9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRK9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRK9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRK9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRK9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRK9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRK9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRK9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRK9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRK9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRK9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
J3QRK9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
J3QRK9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
J3QRK9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRK9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms