Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHMG1C9JSJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms