Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC2BA2VCK2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms