Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms