Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARS2Q9NP81 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms