Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG6Q9BXT2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms