Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF428Q96B54 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms