Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUAP1Q96AJ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLUAP1Q96AJ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms