Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMS2Q7Z4I7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMS2Q7Z4I7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms