Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSSK4Q6SA08 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.1 ms