Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZKSCAN2Q63HK3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms