Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms