Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COLEC12Q5KU26 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms