Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RRN3P1Q2M238 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RRN3P1Q2M238 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RRN3P1Q2M238 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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RRN3P1Q2M238 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
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RRN3P1Q2M238 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RRN3P1Q2M238 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RRN3P1Q2M238 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RRN3P1Q2M238 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RRN3P1Q2M238 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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