Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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