Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms