Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A2Q05940 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms