Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ETV3P41162 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV3P41162 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV3P41162 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV3P41162 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV3P41162 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV3P41162 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV3P41162 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV3P41162 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV3P41162 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV3P41162 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV3P41162 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV3P41162 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV3P41162 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV3P41162 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV3P41162 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV3P41162 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV3P41162 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV3P41162 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV3P41162 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV3P41162 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV3P41162 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV3P41162 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV3P41162 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV3P41162 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV3P41162 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV3P41162 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV3P41162 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV3P41162 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV3P41162 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV3P41162 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV3P41162 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV3P41162 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV3P41162 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV3P41162 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV3P41162 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV3P41162 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV3P41162 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV3P41162 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV3P41162 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV3P41162 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV3P41162 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV3P41162 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV3P41162 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV3P41162 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV3P41162 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV3P41162 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV3P41162 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV3P41162 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV3P41162 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV3P41162 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV3P41162 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV3P41162 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV3P41162 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV3P41162 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV3P41162 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV3P41162 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV3P41162 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV3P41162 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV3P41162 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV3P41162 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV3P41162 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV3P41162 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV3P41162 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV3P41162 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV3P41162 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV3P41162 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV3P41162 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV3P41162 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV3P41162 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV3P41162 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV3P41162 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV3P41162 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV3P41162 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV3P41162 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV3P41162 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV3P41162 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV3P41162 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV3P41162 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV3P41162 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV3P41162 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV3P41162 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV3P41162 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV3P41162 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV3P41162 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV3P41162 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV3P41162 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV3P41162 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV3P41162 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms