Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN2P0C2S0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN2P0C2S0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms