Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMBSP08397 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMBSP08397 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBSP08397 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMBSP08397 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMBSP08397 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMBSP08397 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HMBSP08397 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMBSP08397 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMBSP08397 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMBSP08397 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMBSP08397 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBSP08397 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBSP08397 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBSP08397 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBSP08397 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBSP08397 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBSP08397 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBSP08397 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBSP08397 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBSP08397 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBSP08397 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMBSP08397 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HMBSP08397 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMBSP08397 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMBSP08397 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMBSP08397 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HMBSP08397 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMBSP08397 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBSP08397 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBSP08397 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBSP08397 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBSP08397 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBSP08397 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBSP08397 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBSP08397 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBSP08397 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBSP08397 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBSP08397 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms