Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOL3O95236 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOL3O95236 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOL3O95236 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOL3O95236 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOL3O95236 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOL3O95236 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOL3O95236 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APOL3O95236 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOL3O95236 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOL3O95236 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOL3O95236 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOL3O95236 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOL3O95236 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOL3O95236 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
APOL3O95236 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOL3O95236 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOL3O95236 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOL3O95236 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOL3O95236 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOL3O95236 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOL3O95236 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOL3O95236 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOL3O95236 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOL3O95236 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOL3O95236 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOL3O95236 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOL3O95236 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOL3O95236 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOL3O95236 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOL3O95236 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOL3O95236 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOL3O95236 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOL3O95236 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOL3O95236 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL3O95236 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL3O95236 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL3O95236 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL3O95236 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL3O95236 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL3O95236 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.8 ms