Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAPBPO15533 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAPBPO15533 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAPBPO15533 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms