Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPA5E9PKD4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPA5E9PKD4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPA5E9PKD4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms