Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-3A0A0A0MS03 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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