Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11EQ9UL52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms