Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms