Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5BQ9UGL1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5BQ9UGL1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms